合规搭建集装箱别墅需要遵循以下步骤和原则：

了解法律法规：首先，需要详细了解当地关于建筑和土地使用的法律法规，包括但不限于《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国城乡规划法》等。这些法律法规会规定哪些类型的建筑需要什么样的审批手续，以及哪些区域可以用来建设别墅。

土地使用权的确认：确保你拥有土地使用权或者已经得到合法的土地使用权转让。对于农村集体土地，需要特别关注土地性质和使用权限。

设计合规：集装箱别墅的设计需要符合建筑规范和安全标准。应当委托有资质的设计单位进行设计，并确保设计符合当地的建筑规范和美学要求。

办理审批手续：在开始搭建前，必须向当地城市规划部门提交建筑申请，包括建筑设计图纸、土地使用证明等相关材料，申请建筑许可。

遵守建筑规范：在搭建过程中，要严格按照已经批准的设计图纸进行施工，使用符合国家标准的材料和构件，确保建筑的结构安全。

质量监督：在施工过程中，应接受相关部门的质量监督和安全检查，确保施工质量和安全。

环境保护：在建设和使用过程中，要遵守环境保护法规，合理处理施工废弃物，减少对环境的影响。

后续验收：工程完成后，需要通过相关部门的验收，确保符合所有规定和要求。

以下是一些具体建议：

合规性咨询：在开始之前，可以咨询当地的城市规划部门、住房和城乡建设部门，了解具体的法律法规和审批流程。

专业团队合作：与专业的建筑团队合作，他们通常对当地的法律法规和建筑规范有更深入的了解。

注意安全与环保：在设计和施工过程中，重视安全防护措施和环保要求，确保不对周边环境造成破坏。

总之，合规搭建集装箱别墅是一个涉及多方面因素的复杂过程，需要综合考虑法律法规、设计施工、环境保护等多个方面，以确保项目的合法性和安全性。